NucleusJ: an ImageJ plugin for quantifying 3D images of interphase nuclei
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
SlideJ: An ImageJ plugin for automated processing of whole slide images
The digital slide, or Whole Slide Image, is a digital image, acquired with specific scanners, that represents a complete tissue sample or cytological specimen at microscopic level. While Whole Slide image analysis is recognized among the most interesting opportunities, the typical size of such images-up to Gpixels- can be very demanding in terms of memory requirements. Thus, while algorithms an...
متن کاملTowards many colors in FISH on 3D-preserved interphase nuclei.
The article reviews the existing methods of multicolor FISH on nuclear targets, first of all, interphase chromosomes. FISH proper and image acquisition are considered as two related components of a single process. We discuss (1) M-FISH (combinatorial labeling + deconvolution + wide-field microscopy); (2) multicolor labeling + SIM (structured illumination microscopy); (3) the standard approach t...
متن کاملImageJ-Plugin zur semi-automatisierten Extraktion von morphologischen Blattmerkmalen
Die Auswertung von morphologischen Eigenschaften von Blättern ist eine bewährte Methode zur Bestimmung von Pflanzen. Der hier vorgestellte Ansatz beschreibt ein semi-automatisiertes PlugIn für ImageJ, das mit Methoden der computergestützten Bilderkennung einige Blattmerkmale wie Innenwinkel der Hauptadern des Blattes in einen Feature-Vektor extrahiert und für eine anschließende Klassifizierung ...
متن کاملan application of fuzzy logic for car insurance underwriting
در ایران بیمه خودرو سهم بزرگی در صنعت بیمه دارد. تعیین حق بیمه مناسب و عادلانه نیازمند طبقه بندی خریداران بیمه نامه براساس خطرات احتمالی آنها است. عوامل ریسکی فراوانی می تواند بر این قیمت گذاری تاثیر بگذارد. طبقه بندی و تعیین میزان تاثیر گذاری هر عامل ریسکی بر قیمت گذاری بیمه خودرو پیچیدگی خاصی دارد. در این پایان نامه سعی در ارائه راهی جدید برای طبقه بندی عوامل ریسکی با استفاده از اصول و روش ها...
ColonyArea: An ImageJ Plugin to Automatically Quantify Colony Formation in Clonogenic Assays
The clonogenic or colony formation assay is a widely used method to study the number and size of cancer cell colonies that remain after irradiation or cytotoxic agent administration and serves as a measure for the anti-proliferative effect of these treatments. Alternatively, this assay is used to quantitate the transforming potential of cancer associated genes and chemical agents. Therefore, th...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Bioinformatics
سال: 2014
ISSN: 1460-2059,1367-4803
DOI: 10.1093/bioinformatics/btu774